La mission de l'Institut des sciences de la mer de Rimouski est dédiée à la découverte et à l'avancement des connaissances fondamentales et appliquées des milieux côtiers, afin d'être en mesure d'évaluer les impacts de l'activité humaine sur nos ressources et de développer les outils scientifiques et techniques indispensables à la bonne gestion de notre patrimoine côtier. La formation universitaire du 2e et 3e cycle en océanographie et la diffusion de ces connaissances à la société font partie intégrante de cette mission. La mission de l'ISMER se définit dans une perspective de développement durable et ses chercheurs aspirent à ce que leurs résultats de recherche soient utilisés pour un meilleur emploi des ressources et pour donner des outils aux décideurs en vue de protéger la diversité et l'abondance des espèces présentes en milieu marin. Pour se faire, l'ISMER dispose d'équipements de haute technologie, d'une station aquicole alimentée en eau de mer et d'un navire de recherche ultra moderne, le Coriolis II. Ce navire, d'une longueur de 50 m, est sous la responsabilité de REFORMAR.